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螢光顯微鏡 Fluorescence Microscope
全玻片掃描系統-Zeiss Axioscan 7
#陽明校區，認證制，收費使用，全玻片掃描系統 ZEISS Axioscan 7 Slide Scanner；可批次掃描穿透光、螢光玻片，一次至多12片標準玻片；儀器位置：生醫工程館4F 儀器資源中心438室
倒立螢光顯微鏡 (Fluorescence Microscope)-Leica DMI3000 B
#陽明校區，代管儀器，倒立式螢光顯微鏡，Leica DMI3000B，管理單位：微免所黃麗華老師；儀器位置：生物醫學大樓 R414室
正立式螢光顯微鏡 -Leica DM6000B
#陽明校區，認證制，
正立式電動螢光顯微鏡，Motorized Upright Fluorescence Microscope，
儀器位置：生醫工程館4樓儀器中心
正立式螢光顯微鏡 -Olympus BX63
#陽明校區，認證制，
正立式電動螢光顯微鏡，Motorized Upright Fluorescence Microscope，
儀器位置：守仁樓 B1, B03室
正立式螢光顯微鏡-Olympus BX61
#陽明校區，認證制，
正立式螢光顯微鏡，Upright Fluorescence Microscope，
儀器位置：圖資六樓 639室
全反射螢光倒立顯微系統 Nikon Ti-TIRF-E
#交大校區，收費使用，
全反射螢光倒立顯微系統，Total Internal Reflection Fluorescence Inverted Microscopy System (TIRF)，
儀器位置：博愛校區賢齊館620室
活細胞用倒立式螢光顯微鏡-Olympus IX83
#陽明校區，認證制，收費使用，
活細胞用倒立式電動螢光顯微鏡，Motorized Inverted Fluorescence Microscope with Incubating System，儀器位置：圖資6樓 617室
共軛焦顯微鏡 Confocal Microscope
雙光子雷射掃描共軛焦顯微鏡 Confocal Microscope-Zeiss LSM7MP
陽明校區，Multi-photon Laser Scanning Confocal Microscope， Zeiss LSM7MP，認證操作制，收費使用，儀器位置：圖資大樓6F 640室
雷射掃描共軛焦顯微鏡 Confocal Microscope-Olympus FV10i
#陽明校區，認證制，收費使用，倒立式雷射掃描共軛焦顯微鏡，Inverted Laser Scanning Confocal Microscope，
儀器位置：圖資6樓 617室
雷射掃描共軛焦顯微鏡 Confocal Microscope-Olympus FV1000
#陽明校區，認證制，收費使用，
倒立式雷射掃描共軛焦顯微鏡，Inverted Laser Scanning Confocal Microscope，
儀器位置：守仁樓B1 B03室
雷射掃描共軛焦顯微鏡 Confocal Microscope-Zeiss LSM700
#陽明校區，認證制，收費使用，
倒立式雷射掃描共軛焦顯微鏡，Inverted Laser Scanning Confocal Microscope，
儀器位置：圖資6樓 640室
雷射掃描共軛焦顯微鏡 Confocal Microscope-Zeiss LSM880
#陽明校區，認證制，收費使用，上班時段可由專員協助操作，除Airyscan功能外亦開放自行操作認證；倒立式雷射掃描共軛焦顯微鏡，Inverted Laser Scanning Confocal Microscope，
儀器位置：生醫工程館4樓 儀器中心
高速掃描雷射共軛焦顯微鏡 Leica TCS SP5 II
#交大校區。收費使用，高速掃描雷射共軛焦顯微鏡，High-speed laser scanning confocal microscope, Leica, TCS SP5 II，儀器位置：博愛校區賢齊館620室
雷射掃描共軛焦顯微鏡 Confocal Microscope-Zeiss LSM900
#陽明校區，上班時段可由專員協助操作，除Airyscan功能外亦開放自行操作認證；收費使用，倒立式雷射掃描共軛焦顯微鏡，Inverted Laser Scanning Confocal Microscope，儀器位置：圖資6樓 639室
特殊光學顯微鏡 Advanced Microscope
超解析顯微鏡含活細胞培養系統-Zeiss Elyra 7
#陽明校區，認證制，收費使用，
超解析螢光顯微鏡含活細胞培養系統Super-resolution Microscope with Lattice SIM and Incubating System，儀器位置：圖資6樓 617室